此次文物普查是州市文物局联合进行的。昌吉市文物遗址分布广泛，南到山区，北至沙漠，尤其一些古代游牧民族的墓葬、岩画，更是隐藏于深山中。位于昌吉市阿什里乡二道水村东约9公里处曲形山间崖壁上的山羊圈岩画，被当地被哈萨克牧民称为“山羊圈”。岩画画幅长29米，面积464平方米，岩画对象多为羊、鹿、骆驼等展示了当时的狩猎文化。

昌吉市境内的芦草沟古城位于二六工镇广东户村。芦草沟古城建于清乾隆年间屯田大发展时期，当时驻有千总一员，管理屯田，城堡内有衙署、仓廒、民居等建筑，兴盛一时，至清末废弃。城墙为夯筑，夯层厚10～14厘米，夯窝直径13厘米，构筑物有25～30厘米的木楔和芨芨束。城墙最高处高约2米，底宽2.4米，顶宽0.8米。东南角为一方台，为角楼遗迹。东城门保存较好，位于东墙中部，门道宽7.4米，两侧有门墩。

经过普查，目前，昌吉市已经公布的各级文物保护单位12处，其中国家级重点文物保护单位1处（三十里大墩烽火台），自治区级5处（昌吉古城、清代粮仓、芦草沟古城、新渠古城和山羊圈岩画），县（市）级6处（宁边古城、阿什里岩画、二工庙、干沟岩画、二道水墓群和二六工拱北）。（昌吉市文物局）

图为芦草沟古城

图为山羊圈岩画